Protein–RNA interactions for Protein: P16882

Ghr, Growth hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhrP16882 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GhrP16882 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GhrP16882 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GhrP16882 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GhrP16882 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GhrP16882 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GhrP16882 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GhrP16882 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GhrP16882 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GhrP16882 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GhrP16882 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GhrP16882 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GhrP16882 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GhrP16882 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GhrP16882 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GhrP16882 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GhrP16882 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GhrP16882 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GhrP16882 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GhrP16882 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GhrP16882 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GhrP16882 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GhrP16882 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GhrP16882 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GhrP16882 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GhrP16882 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GhrP16882 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GhrP16882 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GhrP16882 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GhrP16882 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GhrP16882 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GhrP16882 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GhrP16882 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GhrP16882 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GhrP16882 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GhrP16882 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GhrP16882 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GhrP16882 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GhrP16882 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GhrP16882 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GhrP16882 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GhrP16882 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GhrP16882 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GhrP16882 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GhrP16882 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GhrP16882 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms