Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prph2P15499 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prph2P15499 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prph2P15499 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prph2P15499 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prph2P15499 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms