Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Dnmt1P13864 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Dnmt1P13864 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Dnmt1P13864 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Dnmt1P13864 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 379.8 ms