Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF5P13349 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF5P13349 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF5P13349 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF5P13349 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF5P13349 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF5P13349 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF5P13349 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF5P13349 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF5P13349 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF5P13349 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF5P13349 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF5P13349 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF5P13349 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF5P13349 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF5P13349 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF5P13349 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF5P13349 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF5P13349 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF5P13349 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF5P13349 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF5P13349 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF5P13349 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF5P13349 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF5P13349 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF5P13349 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF5P13349 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF5P13349 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF5P13349 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF5P13349 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF5P13349 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF5P13349 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF5P13349 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF5P13349 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF5P13349 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF5P13349 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF5P13349 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF5P13349 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF5P13349 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF5P13349 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF5P13349 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYF5P13349 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF5P13349 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF5P13349 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYF5P13349 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms