Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DmdP11531 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DmdP11531 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DmdP11531 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DmdP11531 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DmdP11531 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DmdP11531 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DmdP11531 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DmdP11531 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DmdP11531 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DmdP11531 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DmdP11531 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DmdP11531 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DmdP11531 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DmdP11531 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DmdP11531 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DmdP11531 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DmdP11531 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DmdP11531 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DmdP11531 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DmdP11531 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DmdP11531 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DmdP11531 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DmdP11531 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DmdP11531 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DmdP11531 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DmdP11531 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DmdP11531 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DmdP11531 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DmdP11531 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DmdP11531 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DmdP11531 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DmdP11531 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DmdP11531 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DmdP11531 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DmdP11531 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DmdP11531 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DmdP11531 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DmdP11531 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DmdP11531 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DmdP11531 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DmdP11531 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DmdP11531 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DmdP11531 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DmdP11531 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DmdP11531 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DmdP11531 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DmdP11531 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DmdP11531 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DmdP11531 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DmdP11531 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DmdP11531 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DmdP11531 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DmdP11531 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DmdP11531 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DmdP11531 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms