Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb4P10284 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb4P10284 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms