Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl1P10146 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms