Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Myod1P10085 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myod1P10085 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myod1P10085 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.7 ms