Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms