Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms