Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06334 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06334 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06334 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06334 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P06334 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06334 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06334 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06334 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06334 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06334 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06334 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06334 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06334 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06334 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06334 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06334 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06334 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06334 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06334 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06334 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06334 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06334 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06334 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06334 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06334 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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