Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-Eb1P04230 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-Eb1P04230 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb1P04230 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb1P04230 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms