Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtnd1P03888 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtnd1P03888 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms