Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01820 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01820 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01820 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01820 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01820 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01820 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01820 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01820 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01820 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01820 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01820 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01820 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01820 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01820 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01820 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01820 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01820 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms