Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01792 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01792 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01792 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01792 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01792 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01792 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01792 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01792 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01792 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01792 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01792 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01792 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01792 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01792 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01792 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01792 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01792 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01792 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01792 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01792 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01792 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01792 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01792 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01792 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01792 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01792 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01792 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01792 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01792 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01792 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01792 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01792 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01792 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01792 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01792 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01792 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01792 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01792 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01792 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01792 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01792 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01792 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01792 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01792 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01792 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01792 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01792 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01792 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01792 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01792 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01792 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01792 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01792 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01792 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01792 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01792 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms