Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01788 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01788 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01788 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01788 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01788 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01788 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01788 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01788 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01788 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01788 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01788 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01788 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01788 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms