Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01728 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01728 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01728 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01728 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01728 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01728 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01728 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01728 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01728 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01728 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms