Protein–RNA interactions for Protein: P01726

Ig lambda-1 chain V region H2020, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01726 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01726 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01726 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01726 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01726 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01726 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01726 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01726 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01726 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01726 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01726 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01726 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01726 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01726 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01726 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01726 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01726 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01726 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01726 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01726 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01726 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01726 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01726 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01726 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms