Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01724 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01724 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01724 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01724 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01724 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01724 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01724 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01724 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01724 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01724 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01724 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01724 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01724 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01724 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01724 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01724 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01724 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01724 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01724 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01724 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01724 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01724 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01724 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01724 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01724 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms