Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfi1bO70237 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1bO70237 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms