Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NlkO54949 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NlkO54949 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NlkO54949 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NlkO54949 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NlkO54949 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NlkO54949 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NlkO54949 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NlkO54949 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NlkO54949 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NlkO54949 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NlkO54949 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NlkO54949 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NlkO54949 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NlkO54949 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NlkO54949 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NlkO54949 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NlkO54949 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NlkO54949 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NlkO54949 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NlkO54949 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NlkO54949 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NlkO54949 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NlkO54949 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NlkO54949 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NlkO54949 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NlkO54949 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NlkO54949 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NlkO54949 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NlkO54949 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NlkO54949 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NlkO54949 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NlkO54949 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NlkO54949 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms