Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms