Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold2O35654 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pold2O35654 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold2O35654 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms