Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn1mwO35599 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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