Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Ptpn9O35239 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Ptpn9O35239 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn9O35239 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Ptpn9O35239 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Ptpn9O35239 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ptpn9O35239 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ptpn9O35239 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ptpn9O35239 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ptpn9O35239 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ptpn9O35239 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Ptpn9O35239 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Ptpn9O35239 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ptpn9O35239 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Ptpn9O35239 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn9O35239 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms