Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf11O35235 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms