Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpaO35216 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpaO35216 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpaO35216 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpaO35216 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms