Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn4O35054 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Cldn4O35054 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cldn4O35054 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms