Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Q1O19441 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-Q1O19441 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Q1O19441 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms