Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casq1O09165 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casq1O09165 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casq1O09165 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casq1O09165 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casq1O09165 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casq1O09165 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casq1O09165 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casq1O09165 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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