Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema4dO09126 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms