Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata2O09100 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata2O09100 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata2O09100 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata2O09100 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata2O09100 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata2O09100 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms