Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eftud2O08810 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms