Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21060J3KMU4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms