Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21897J3KMP5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21897J3KMP5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms