Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20830J3KML6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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