Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
4933406M09RikG3XA12 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933406M09RikG3XA12 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4933406M09RikG3XA12 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933406M09RikG3XA12 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933406M09RikG3XA12 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms