Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8909G3UXE9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8909G3UXE9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms