Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp72F8VQC1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms