Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp32F8VPZ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp32F8VPZ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp32F8VPZ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp32F8VPZ3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp32F8VPZ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp32F8VPZ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp32F8VPZ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp32F8VPZ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.7 ms