Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Farp1F8VPU2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms