Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms