Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Crocc2F6XLV1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Crocc2F6XLV1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms