Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28374F6SG70 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28374F6SG70 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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