Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4E9QAP7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4E9QAP7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4E9QAP7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4E9QAP7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4E9QAP7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf4E9QAP7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf4E9QAP7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms