Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430401F13RikE9Q328 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430401F13RikE9Q328 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms