Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf2bp2E9Q1P8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf2bp2E9Q1P8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms