Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Zfp558E9Q1J0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Zfp558E9Q1J0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp558E9Q1J0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp558E9Q1J0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp558E9Q1J0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Zfp558E9Q1J0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Zfp558E9Q1J0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Zfp558E9Q1J0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp558E9Q1J0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Zfp558E9Q1J0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Zfp558E9Q1J0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Zfp558E9Q1J0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp558E9Q1J0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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