Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms