Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf11E9PZM7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms